JR九州は、地震の影響で一部区間の運行見合わせが続いているJR鹿児島線の振り替え輸送を、9月18日以降新幹線で行うと発表しました。在来線の定期券で新幹線に乗車できます。JR鹿児島線は、宇土駅と八代駅の間で運行見合わせが続いていてその区間を代行バスで運行しています。九州新幹線も熊本駅と新水俣駅の間で運行を取りやめていますが、9月18日の始発から全線で運行を再開する予定です。