ドワンゴが運営する動画サービス「niconico」の「ニコニコ生放送」にて、2018年8月28日（火）8時から8月31日（金）24時まで展開された生放送企画「『涼宮ハルヒの憂鬱/エンドレスエイト』88時間生放送〜およそ1/9077長門有希体験〜」終了後に、9月1日（土）20時30分より、アニメーション映画「涼宮ハルヒの消失」を放送するとが発表された。本企画では、TVアニメ「涼宮ハルヒの憂鬱」シリーズ「エンドレスエイト」の登場人物同様に