日本航空(JAL)は、エア・ベルリンの運航停止に伴い、JALとエア・ベルリンの共同運航(コードシェア)便も運休する。

10月28日以降の、JALのコードシェア便を含む全てのエア・ベルリン運航便が運休の対象で、予約客にはJALより連絡を行う。旅行会社を通じて手配を行った場合、旅行会社に問い合わせるよう呼びかけている。

特別取り扱いに関する詳細は、日本国内からはJAL国際線予約(電話:0570-025-031/午前8時〜午後7時・年中無休)、海外からはJALグループ支店・営業所、特典航空券に関しては登録住所を管轄するJALマイレージバンク(JMB)会員専用国際線予約やJMBセンターへ連絡するよう呼びかけている。